SS4I: select SNP subset for imputation
Résumé
Ce logiciel, développé en Python, permet de sélectionner un panel réduit de SNP pour la réalisation de puce basse densité et pour l'imputation vers des données de génotypage de haute densité. La sélection de SNP s'effectue en tenant compte du déséquilibre de liaison (r2) entre les différentes pairs de SNP au sein d'un chromosome.